• Fertőzések
A tünetek kialakulása összefüggésbe hozható valamilyen vírus, baktérium, gomba okozta hatással, de előfordulhat, hogy valamilyen nagyobb szervet élősködését találjuk a háttérben. Ezekben az esetekben a fertőző organizmus által termelt anyagok, a szaporodásukhoz a szervezetből elvont anyagok, illetve az általuk okozott irritáció okozzák a problémákat.
Az immunrendszer feladata, hogy a betolakodókat elpusztítsa, ezt a fehérvérsejtek egy speciális csoportja végzi el. Ezt a folyamatot lehet támogatni antibiotikumokkal, bár mindig számolni kell azzal a mellékhatással, hogy a szervezet saját sejtjei is érzékenyek lehetnek
az ilyen kezelésre.
• Nem fertőzés okozta gyulladások
van néhány, tápcsatornát érintő megbetegedés, amelynek tünetei a gyulladásos megbetegedésekhez
nagyon hasonlók .
• IBS irritábilis bél szindróma
Az IBS idült bélműködési rendellenesség, funkcionális probléma, amely krónikus vagy visszatérő emésztőszervi tünetek jellegzetes kombinációja. Tünetei: görcsös hasi fájdalom, székürítési problémák, puffadás, felső emésztő rendszer rendellenességei . Létrejöttének okai között a bélflóra megváltozása, nem tolerálható anyagok felszabadulása az emésztőrendszerben, de számtalan stressz és lelki tényező is szerephez juthat.
• Collítis ulcerosa, Crohn betegség
A gyulladásos bélbetegségek ismeretlen eredetű) két formája a colitis ulcerosa és a Crohn-betegség. A betegségek kialakulásában környezeti tényezők (étkezés, dohányzási szokások, stb.), illetve genetikai tényezők és immunológiai eltérések játszanak szerepet.
A nem ferőzés okozta gyulladások komoly kihívást jelentenek a kezelés irányát illetően, ugyanis az antibiotikumos kezelés csak az esetleges felülfertőződésre gyakorol hatást, az alapproblémára nincs hatással.
.